Находясь в меню выбора систем входим в командный режим нажав на клавиатуре 'C'
Набираем root(hd и жмём два раза tab. Из появившегося списка разделов выбираем тот, который нам нужен (например тип раздела ntfs это 0x7)
Дописываем до конца, пусть в нашем случае это будет root (hd0,5)
Далее вводим команды:

chanloader +1 (это значит что для загрузки системы будет использоваться загрузчик с нашего root раздела, т.е. (hd0.5) размером в 512*1 байт)
boot

т.е. выходит всего три команды:
root (hd0,5) chanloader +1 boot

PS: если система в списке есть, но неверно указаны некоторые параметры, например раздел загрузки или опции ядра для linux, то вы можете использовать клавишу 'E' для редактирования. Изменения не сохраняются в menu.lst, но позволяют загрузить нужную нам систему.